中国儿童急性淋巴细胞性白血病染色体6q16.3～21区域候选肿瘤抑制基因的定位与鉴定

• 作者: 俞燕 吴秀山 康睿 张朝霞 曹励之 杨明华 王卓 胡婷 谢岷 谭志红 郭碧贇 陈英
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 医学
• 关键词: 儿童急性淋巴细胞性白血病 6q16.3～21 肿瘤抑制基因 杂合性缺失 表达序列标签(EST) 数字化差异表达分析
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 65-71
• 页数: 7页
• 分类号: R725.5
• 字数: 4517字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2006.01.010

摘要

为了克隆儿童急性淋巴细胞性白血病(ALL)候选肿瘤抑制基因,首先选取分布于6q16.3～21上的11个多态性微卫星标记,对139例中国儿童ALL标本进行杂合性缺失(LOH)分析.分析显示32%的患者存在至少一个位点的LOH,且高频缺失区位于D6S1709～D6S301之间,大小为2cM.各位点LOH与白细胞总数、病态细胞数有显著性相关(P＜0.05),与年龄、性别、形态学分型和免疫学分型无显著相关(P＞0.05).进一步在高频缺失区域内,采用定位候选克隆策略、生物信息学技术及RT-PCR技术筛选、鉴定与儿童ALL相关的候选肿瘤抑制基因及其cDNA片段.在D6S1709～D6S301之间筛选到一个在儿童ALL细胞中低表达的EST(GenBank登录号:AA403058),与正常外周血单个核细胞比较,在15例ALL患者中有10例表达下调(P＜0.05).采用数字化差异表达分析显示,位于6q16.3～21区域内的AMD1基因、PPIL6基因和WASF1基因在肿瘤组织中的表达丰度要低于正常组织(P＜0.05).上述结果为进一步在6q16.3～21区域克隆肿瘤抑制基因提供了线索.