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基于16S rDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系
基于16S rDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系
作者:
丁少雄
尤颖哲
庄轩
李祺福
王军
王颖汇
苏永全
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
石斑鱼亚科
16S rDNA
系统进化
摘要:
石斑鱼因其种类繁多、分布广泛及缺乏显著的形体特征,使其系统分类的研究颇为困难.为探讨中国近海石斑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属30个种类的线粒体16S rDNA基因片段序列.采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura 2-parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank石斑鱼属的同源序列,以多纹长尾NFDA7(Pronotogrammus multifasciatus)和皮氏叫姑鱼(Johnius belengerii)为外群构建NJ、MP和ML系统树.根据所得分子依据并结合形态学特征,推论如下:1)在本研究的30种石斑鱼中,鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,并呈明显单系性;九棘鲈属(Cephalopholis)是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;侧牙鲈属(Variola)的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间; 2)宽额鲈(Promicrops lanceolatus)可以归入石斑鱼属, 而驼背鲈(Cromileptes altivelis)也与石斑鱼属有很近的亲缘关系,甚至可能是石斑鱼属内的特化类群; 3)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关,暗示了石斑鱼属早期的分化模式[动物学报 52(3):504-513,2006].
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文献信息
篇名
基于16S rDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系
来源期刊
动物学报
学科
生物学
关键词
石斑鱼亚科
16S rDNA
系统进化
年,卷(期)
2006,(3)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
504-513
页数
10页
分类号
Q95
字数
6936字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-5507.2006.03.011
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
尤颖哲
18
228
6.0
15.0
2
李祺福
厦门大学生物学系
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17.0
24.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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节点文献
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16S rDNA
系统进化
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研究来源
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动物学报(英文版)
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国动物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-5507
CN:
11-5794/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院中国科学院动物所
邮发代号:
创刊时间:
1935
语种:
eng
出版文献量(篇)
2363
总下载数(次)
0
总被引数(次)
24243
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
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