茶树EST-SSR的信息分析与标记建立

• 作者: 卢美贞 姚艳玲 崔海瑞 忻雅 金基强 陈文岳 龚晓春
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 EST SSR信息 标记建立
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 17-23
• 页数: 7页
• 分类号: S571.1|Q523
• 字数: 4109字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-369X.2006.01.003

摘要

在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06 bp,平均分布频率是1/2.61 kb.在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复.设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系.以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43 DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%.本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔海瑞	浙江大学原子核农业科学研究所	61	2119	27.0	45.0
2	陈文岳		43	354	8.0	18.0
3	金基强	浙江大学原子核农业科学研究所	6	262	4.0	6.0
4	龚晓春	浙江大学原子核农业科学研究所	3	253	3.0	3.0
5	忻雅		46	314	8.0	17.0
6	卢美贞	浙江大学原子核农业科学研究所	8	200	5.0	8.0
7	姚艳玲	浙江大学原子核农业科学研究所	9	245	6.0	9.0