根癌农杆菌Ti和AT质粒基因组中的分泌型信号肽分析

• 作者: 何月秋 罗灯涛 范成明 范继英 赵明富
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 信号肽 信号肽预测 根癌农杆菌 质粒 筛选
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 265-268
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 3106字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2006.02.024

摘要

利用Signal P3.0和PrediSi软件结合L值和TMHMM筛选,对根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)C58 Cereon菌株的Ti和AT质粒所编码的745个ORF编码蛋白中的信号肽进行了预测,发现35条为分泌型蛋白,其中6条属于RR-motif型信号肽,2条蛋白的信号肽为细菌素-信息素型信号肽,新注释了24条分泌型信号肽,其中1条来自Ti质粒,23条来自AT质粒的蛋白.这些信号肽N结构域的长度变化为2～19aa,平均为6.8aa,H结构域的长度变化为8～34aa,平均为17.1aa.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何月秋	云南农业大学植物保护学院	167	1909	24.0	36.0
2	赵明富	云南农业大学植物保护学院	31	216	9.0	13.0
3	范成明	云南农业大学植物保护学院	13	291	9.0	13.0
4	罗灯涛	云南农业大学植物保护学院	2	7	1.0	2.0
5	范继英	云南农业大学植物保护学院	2	25	1.0	2.0