陆地棉CC-NBS-LRR基因的克隆及特征分析

• 作者: 何晓兰 佘建明 倪万潮 姚姝 张保龙 张香桂 徐英俊 杨郁文 沈新莲
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 CC-NBS-LRR基因 GHNBS 基因表达
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 页码范围: 351-355
• 页数: 5页
• 分类号: S5
• 字数: 2686字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2006.04.007

摘要

根据抗病基因核苷酸结合位点(Nucleotide binding site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增.获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5'调控序列.此基因被命名为GHNBS.该基因的编码区长2 583 bp,编码861个氨基酸,GHNBS编码的氨基酸序列与拟南芥R基因具有28%的同源性.GHNBS与拟南芥的其他几个NBS-LRR基因比较发现,它们在保守区外的相似性相当低.Southern杂交和网上数据库搜索分析都表明GHNBS是1个寡拷贝基因.通过半定量RT-PCR分析发现GHNBS在棉花的蕾、花瓣、韧皮部、根及叶中均有表达且在根、叶中表达量比其它部位强,在木质部基本不表达.