基于β-微管蛋白基因部分序列探讨灵芝属菌株的亲缘关系

• 作者: 唐传红 张劲松 潘迎捷 苏春丽
• 来源期刊: 菌物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 序列分析 neighbour-joining methods 聚类分析 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 439-445
• 页数: 7页
• 分类号: Q94
• 字数: 3616字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6472.2006.03.017

摘要

PCR分别扩增了38个灵芝属菌株的β-微管蛋白基因片段,并对PCR产物进行序列测定,得到419bp的一段核苷酸系列.根据MEGA 2.1软件中的neighbour-joining methods对上述序列进行聚类分析,结果所有供试菌株被分成9个聚类组.中国栽培灵芝菌株分布于6个聚类组,其中树舌亚属、紫芝组的菌株各自聚成一组,灵芝组的菌株分成四组,但大部分灵芝组菌株均聚于同一组, 这表明树舌亚属、紫芝组和灵芝组间的遗传差异较大,灵芝组内虽然存在着一定的遗传差异,但总体上亲缘关系比较近,遗传多样性并不丰富.同时,序列分析的结果显示,β-tubulin基因序列在第三位密码子和内含子部位有高的碱基替换率,这些变异提供了丰富的系统发育信息,提示β-tubulin基因适合于灵芝属菌株的亲缘关系研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘迎捷	上海水产大学食品科学学院	67	1254	19.0	32.0
2	张劲松	上海农业科学院食用菌研究所	9	292	8.0	9.0
3	苏春丽	南京农业大学生命科学学院微生物系	3	103	3.0	3.0
7	唐传红	上海农业科学院食用菌研究所	2	88	2.0	2.0