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摘要:
根据中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)Hsp70的cDNA序列及日本对虾(Marsupenaeus japonicus)Hsp70 cDNA序列片段设计引物,用RT-PCR方法,从经热休克处理的日本对虾鳃总RNA中克隆到长1992 bp的Hsp70 cDNA序列,包括长1959 bp的完整编码序列(CDS).根据编码序列推导出相应的652个氨基酸,与其他真核生物Hsp70家族成员进行同源性比较,发现与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、斑节对虾(Pinaeus monodon Fabricius)、中国明对虾(Penaeus chinesis)的相似度分别为99.5%、99.4%、99.4%,与日本沼虾(Macrobrachium nipponense)和罗氏沼虾(M.rosenbergii)的相似度分别为93.7%和92.9%,与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、原鸡(Callus gallus)、家鼠(Mus musculus)和人(Homo sapiens)的相似度为89.2%、85.4%、88.3%和88.3%,表现出较高的保守性.分析表明所得到的日本对虾Hsp70是一种Dnak亚家族类型的细胞质Hsp70,拥有完整的N端ATP酶结构域(约45 kDa)、底物肽结合结构域(18 kDa)及C端结构域(10 kDa).以上结果说明我们所得到的序列是一条包含完整CDS的Hsp70基因序列.
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文献信息
篇名 日本对虾(Marsupenaeys japonicus)HsP70基因cDNA的克隆与序列分析
来源期刊 生态科学 学科 生物学
关键词 Hsp70基因 全长编码序列 日本对虾
年,卷(期) 2006,(5) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 440-444
页数 5页 分类号 Q178.531|Q591.3
字数 2861字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1008-8873.2006.05.014
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张其中 暨南大学水生生物研究所 58 636 15.0 22.0
2 张占会 暨南大学水生生物研究所 15 94 6.0 9.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
Hsp70基因
全长编码序列
日本对虾
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生态科学
双月刊
1008-8873
44-1215/Q
16开
广州暨南大学水生态科学研究所
1982
chi
出版文献量(篇)
2960
总下载数(次)
7
总被引数(次)
30030
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
广东省自然科学基金
英文译名:Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:研究团队
学科类型:
论文1v1指导