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一个新的家蚕转录相关锌带蛋白基因的克隆及序列分析
一个新的家蚕转录相关锌带蛋白基因的克隆及序列分析
作者:
冯姗
张耀洲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
家蚕
锌带蛋白基因
电子克隆
基因克隆
序列分析
摘要:
锌带蛋白(zinc ribbon protein)是锌指类蛋白的一种,它的Cys4 Zn(2+)结合位点由3个β2片层折叠而成,而不是α螺旋结构.锌带结构与锌指结构同为转录因子结合核酸的结构域,锌带蛋白作为转录相关因子在调节基因表达活性等方面具有重要作用.在对家蚕Bombyx mori蛹cDNA文库测序中,发现一个新的编码家蚕锌带蛋白基因的EST序列(GenBank登录号DY230964),以此序列为信息探针检索家蚕EST数据库,通过同源筛选,获得一个新的家蚕锌带蛋白基因cDNA全序列并经RT-PCR检测和克隆、测序验证,结果表明与电子克隆序列完全一致.我们将其命名为BmZNRD1(Zinc Ribbon Domain Containing 1)(GenBank登录号DQ432055).该基因全长为675bp,由363 bp的开放阅读框序列(ORF)、10 bp的5′端非翻译区序列(5′UTR)和302 bp的3′端非编码区序列(3′UTR)组成,其编码的120个氨基酸序列与其他真核生物间具有较高的同源性(达60%左右),预测分子量为13.54kD,等电点为6.8.BmZNRD1编码的氨基酸序列是一种锌带蛋白,推测有2个功能结构域,分别是位于N-端的Cx2Cx14Cx2C和C-端的Cx2Cx24Cx2C,其中C-端保守氨基酸序列Cx2Cx6Yx3QxRSADEx2TxFx2Cx2C在生物进化中保守性很高,从酵母、果蝇、线虫到两栖类、哺乳类都有发现该结构域的存在,与酵母RNA聚合酶A亚单位9和转录相关蛋白有很高的相似性,推测其具有相同的功能.将BmZNRD1基因cDNA序列与家蚕基因组序列进行比对,结果表明该基因具有3个外显子,2个内含子,外显子/内含子边界符合经典的GT-AG规则.
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
一个新的家蚕转录相关锌带蛋白基因的克隆及序列分析
来源期刊
昆虫学报
学科
农学
关键词
家蚕
锌带蛋白基因
电子克隆
基因克隆
序列分析
年,卷(期)
2006,(5)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
726-732
页数
7页
分类号
S881.2|Q78
字数
5200字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0454-6296.2006.05.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张耀洲
浙江理工大学生物化学研究所
87
372
9.0
15.0
2
冯姗
浙江大学生物化学研究所
1
0
0.0
0.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(37)
参考文献
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节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1988(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1991(2)
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1993(1)
参考文献(1)
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1994(1)
参考文献(0)
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二级参考文献(2)
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参考文献(0)
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参考文献(2)
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参考文献(1)
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二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
家蚕
锌带蛋白基因
电子克隆
基因克隆
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
49239
相关基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:
National Basic Research Program of China
官方网址:
http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:
农业
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
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