抑制差减杂交法克隆牙鲆变态早期差异表达的基因

• 作者: 任大明 施志仪 杨桂梅 鲍宝龙
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 抑制差减杂交 牙鲆 变态早期 变态前 差异表达 相对定量RT-PCR
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 页码范围: 204-210
• 页数: 7页
• 分类号: Q344+.13|S917
• 字数: 4527字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2006.02.011

摘要

为了克隆变态早期牙鲆头部差异表达的基因,采用抑制差减杂交法,以变态前的仔鱼头部表达的RNA作为驱动RNA,建立了牙鲆变态早期的差减cDNA文库,并利用相对定量RT-PCR对其进行了筛选.差减库的平均插入片段558 bp左右,阳性率为81.8%.随机测定的45个克隆,在剔除假阳性克隆后,共得到22个不同的基因,其中13个为已知cDNA的同源基因,而另外9个为已知蛋白的同源基因,分别为prolactin receptor-like,COL1A1,M3-muscarinic receptor,Sfrs3,tropomyosin,ribosomal protein L27,ribosomal protein S12,GAPDH,COL1A3.在所有22个基因中,COL1A1基因在差减库中的分布频率最高,为22.2%.RT-PCR检测结果表明,在所检测的11个基因中,所有基因在右眼移动前后的牙鲆头部均有表达,只是体现在表达水平上的不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任大明	复旦大学遗传工程国家重点实验室	98	819	15.0	24.0
2	鲍宝龙	上海水产大学生命科学与技术学院	16	228	10.0	15.0
6	杨桂梅	上海水产大学生命科学与技术学院	8	104	6.0	8.0
7	施志仪	上海水产大学生命科学与技术学院	22	419	12.0	20.0