基于密码子使用模式的冠状病毒亲缘关系分析

• 作者: 张建辉
• 来源期刊: 天津理工大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: SARS 冠状病毒 密码子使用 亲缘树
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 页码范围: 74-77
• 页数: 4页
• 分类号: Q523+.1
• 字数: 2092字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-095X.2006.06.022

摘要

SARS冠状病毒是一种新的冠状病毒,已经被确定为引起SARS即非典型肺炎的病原体.本文提出了一种基于密码子使用模式的冠状病毒亲缘关系研究方法.即是选择冠状病毒基因组中RdRp基因的密码子使用率代表该病毒,来计算物种之间的进化距离,并以此构建了冠状病毒亲缘树.而在单独分析SARS冠状病毒和类SARS冠状病毒的亲缘关系时,我们用这些病毒基因组全部基因序列的密码子使用率代表该物种,来计算它们之间的进化距离,构建了只包含源自于不同时期不同病原体的SARS冠状病毒和类SARS冠状病毒的亲缘树.以上两项工作基本上反映了SARS冠状病毒与原有冠状病毒之间的亲缘关系,同时也揭示了SARS冠状病毒自身的进化过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张建辉	天津大学应用物理系	6	99	5.0	6.0