不同血清型变形链球菌表面蛋白可变区(extended-V)的同源性分析

• 作者: 何奎芳 刘天佳 刘建国 庄姮 李颂 杨德琴
• 来源期刊: 华西口腔医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 变形链球菌 血清型 extended-V区 同源性分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 专栏论著
• 页码范围: 370-373
• 页数: 4页
• 分类号: Q523
• 字数: 3609字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-1182.2006.04.023

摘要

目的 分析不同血清型变形链球菌表面蛋白可变区(extended-V)的基因及蛋白质的同源性,探讨该区在防龋疫苗研制中的作用.方法 以变形链球菌血清型c、d、f、g参考株及部分c型临床株为模板,PCR扩增SrV+区片段,通过内切酶Dde Ⅰ进行限制性片段长度多态性分析并测序,将其测序结果在NCBI服务器上用blastn搜索软件进行同源性比较.结果 在相同条件下血清c、f型菌株均扩增出约1.13 kb左右的片段,酶切后出现5种基因型(A、B、C、D、E).选取所占比例较多的A、B、C型代表株进行测序,经比较显示其基因型间的同源性达92%-98%.血清d、g型无扩增产物,将g型6715表面蛋白SpaA全片段基因同OMZ175的产物序列在blastn上进行比较,有3个大小不一的片段出现同源性;血清d型OMZ176的表面蛋白基因序列在GeneBank上未能查出,故无法比较,但其相应蛋白质的同源性也在77%-82%之间,显示出相当高的同源性.结论 就c、f型菌株来说,可以将该区纳入疫苗的研究范畴;d、g型虽未能扩增出相应产物,但其基因还是存在部分区域的相似性,且其蛋白质同源性很高,也可以考虑利用d、g型上同c、f型共有的某些肽段进行疫苗的研制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘建国	遵义医学院附属口腔医院口腔内科	128	653	13.0	17.0
2	杨德琴	遵义医学院附属口腔医院口腔内科	37	249	9.0	13.0
3	刘天佳	四川大学华西口腔医院牙体牙髓科	105	1268	20.0	29.0
4	庄姮	四川大学华西口腔医院牙体牙髓科	16	178	8.0	13.0
5	何奎芳	温州医学院附属口腔医院口腔内科	10	46	4.0	6.0
6	李颂	四川大学华西口腔医院牙体牙髓科	11	96	7.0	9.0