哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析

• 作者: 佟广香 匡友谊 孙效文 尹家胜 梁利群 鲁翠云
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 哲罗鱼 微卫星 磁珠富集
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 181-186
• 页数: 6页
• 分类号: Q959.466
• 字数: 3877字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2006.02.003

摘要

采用磁珠富集法构建哲罗鱼(Huchotaimen Pallas)基因组微卫星文库.哲罗鱼基因组DNA经MboⅠ限制性内切酶消化后,选取400～900 bp的片段,用生物素标记的简单重复序列(ACA)15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,获得目的片段,连接T载体克隆,构建基因组微卫星富集文库.再用同位素标记的(ACA)15探针进行二次筛选,筛选出686个阳性克隆,阳性克隆率为35.94%.对其中140个阳性克隆进行测序,共获得149个微卫星序列,4个小卫星序列,其GenBank Accession Number为DQ110955～DQ121108.其中perfect(完美型)62个,占41.61%;imperfect(非完美型)92个,占61.74%;compound(混合型)5个,占3.36%,重复次数主要分布于6～45(81.21%),平均重复次数为32.5,这表明(ACA/TGT)n在哲罗鱼基因组DNA中含量非常丰富.本研究旨为从DNA水平上研究哲罗鱼种群结构、遗传多样性及目前群体现状等方面提供有效工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尹家胜	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	165	2289	27.0	37.0
2	匡友谊	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	62	948	19.0	28.0
3	佟广香	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	57	642	12.0	22.0
5	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
6	梁利群	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	91	2491	28.0	47.0
7	鲁翠云	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	47	1092	18.0	32.0