动态性状基因座的复合区间定位

• 作者: 杨润清 高会江
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 动态性状 复合区间定位 Legendre多项式 极大似然估计 EM算法
• 年，卷（期）: 2006,（13）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1552-1557
• 页数: 6页
• 分类号: Q3
• 字数: 5036字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2006.13.012

摘要

动态性状因其广泛性和重要性而备受动植物遗传育种研究者关注.用分子遗传学方法探索该类性状的遗传机制已成为一个极富挑战性的研究课题.将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL和协同因子对动态性状变化过程的作用,从而建立动态性状基因复合区间定位分析的数学模型.利用复合区间定位策略的优势,提高对控制动态性状多个QTL的检测效力.以F2设计群体为例,阐述了动态性状基因复合区间定位的似然分析原理,推导了参数似然估计的EM法两步求解过程.模拟实验证明,相同设计条件下,复合区间定位对分布在同一连锁群上多个影响动态性状QTL的检测效果明显好于区间定位;随着协同因子数目的增加,复合区间定位不但能检测出更多的甚至所有的QTL,而且对每个QTL分辨得更加清楚.在实际应用过程中,应针对动态性状的变化规律,并考虑计算成本恰当地选择协同因子数目.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高会江	东北农业大学动物科学技术学院	18	199	9.0	14.0
2	杨润清	上海交通大学农业与生物学院	19	114	5.0	10.0