条斑紫菜锰超氧化物歧化酶基因克隆与序列分析

• 作者: 刘涛 周晓君 庄筠昀 王荣 茅云翔
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 地球科学
• 关键词: 条斑紫菜 锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD)基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 资源环境技术
• 页码范围: 522-528
• 页数: 7页
• 分类号: X7
• 字数: 5622字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2006.05.016

摘要

为研究紫菜抗逆抗病的分子机制,以本实验室建立的条斑紫菜表达序列标签(EST)和全长cDNA富集文库,结合PCR技术,克隆了条斑紫菜编码锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD)的cDNA及基因组DNA全长序列,并进行了序列特性相关分析.研究结果表明:该基因cDNA序列全长为958个核苷酸,包含一个完整Mn-SOD基因的ORF,编码224个氨基酸和终止密码子;该基因在基因组中序列长度为1416bp,包含4个外显子和3个内含子,这既不同于高等植物的6个外显子和5个内含子,也不同于人的5个外显子和4个内含子;该基因编码区密码子的平均GC含量为60.9%,第三位密码子的GC含量高达84.9%;序列中包含4个与Mn2+的结合位点及一个保守的金属结合结构域,预测分子量为24469.09Da,等电点为5.99;条斑紫菜Mn-SOD与人的相关蛋白具有类似的空间结构,都有6个跨膜α螺旋结构域;由cDNA序列推导的氨基酸序列与莱茵衣藻相似性为57.7%,系统发生分析表明条斑紫菜Mn-SOD与绿藻莱茵衣藻和硅藻海链藻的亲缘关系较近.这是该基因在红藻门中的首次报道.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	茅云翔	中国海洋大学海洋生命学院	39	535	10.0	22.0
2	刘涛	中国海洋大学海洋生命学院	110	1040	16.0	26.0
3	庄筠昀	中国海洋大学海洋生命学院	2	42	2.0	2.0
4	王荣	中国海洋大学海洋生命学院	10	61	4.0	7.0
5	周晓君	中国海洋大学海洋生命学院	2	36	2.0	2.0