青蟹线粒体COI假基因的分离和特征分析

• 作者: 乔振国 张凤英 马凌波 马春艳
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 青蟹 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因 线粒体假基因
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 43-49
• 页数: 7页
• 分类号: S917|Q523+.8
• 字数: 5641字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2006.01.010

摘要

线粒体DNA标记在遗传结构和系统进化研究中得到广泛应用,然而核假基因的存在对此有很大威胁.本文以中国东南沿海的青蟹(Scylla paramamosain)为研究对象,利用线粒体COI基因的通用引物和特异性引物进行扩增,分别得到34个假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes,Numts)和5个线粒体COI基因序列.在所获得的34个假基因中共定义了29种单倍型,根据序列的相似度,这些假基因可以分为2类,每类假基因都有各自保守的核苷酸序列.第Ⅰ类假基因存在2处插入序列和1处8 bp的缺失序列,这些位点导致了整个阅读框的移位;在第Ⅱ类假基因和5个线粒体COI序列中只有碱基替换,未发现插入和缺失序列.实验结果分析表明,这两类假基因分别代表了2次核整合事件,即核转移事件的最低值.研究结果提示了利用线粒体DNA进行青蟹遗传结构和系统进化研究时应警惕假基因的干扰.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张凤英	农业部海洋与河口渔业重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	7	165	6.0	7.0
2	马凌波	农业部海洋与河口渔业重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	7	168	6.0	7.0
3	马春艳	农业部海洋与河口渔业重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	7	145	6.0	7.0
4	乔振国	农业部海洋与河口渔业重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	3	69	3.0	3.0