基于全长cDNA序列的小麦cSNP发掘

• 作者: 周荣华 景蕊莲 毛新国 汤继凤 贾继增
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 单核苷酸多态性 基因组供体 转换 颠换 单体型
• 年，卷（期）: 2006,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1836-1840
• 页数: 5页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2006.12.010

摘要

以测序得到的来自小麦不同基因组的基因序列为源序列,用AutoSNP软件,在GenBank中的小麦EST库中检测到一批cSNP,开辟了一条发掘小麦基因组特异候选cSNP的新途径.在2089个源序列中,检测到1 296个cSNP,其中有397个来自A基因组,322个来自S基因组,420个来自D基因组;另外,A和D基因组共有的SNP有154个,A和S,S和D,A、S和D基因组共有的SNP各仅有1个,这一结果也同时表明,小麦的3个基因组供体种中,A、D基因组关系比较近,而它们与S基因组的关系比较远.统计分析表明,小麦中SNP出现的频率约为0.914‰.