脑膜瘤病理级别基因诊断芯片数学模型的建立

• 作者: 丁学华 候立军 卢亦成 李瑶 楼美清 白如林 董艳 蔡如珏 陈志刚 陶英群 骆纯 魏庆
• 来源期刊: 中华神经医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 脑膜瘤 表达谱芯片 基因 聚类
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 6-9
• 页数: 4页
• 分类号: R739.41
• 字数: 3257字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1671-8925.2006.01.003

摘要

目的根据脑膜瘤基因表达谱,寻找脑膜瘤病理分级(WHO 2000标准)的分子生物学依据,并建立脑膜瘤病理级别基因诊断芯片的数学模型.方法利用cDNA芯片技术建立24例脑膜瘤基因表达谱数据库,应用生物信息学分析软件GeneMaths 2.0对脑膜瘤基因表达谱数据进行"非监督"样本聚类分析(Hierarchical聚类),将聚类结果与脑膜瘤样本的病理级别进行相关性分析;应用SAS9.0软件,用"贝叶斯判别法"建立脑膜瘤病理级别诊断的判别函数方程;对于脑膜瘤基因表达谱的数据可靠性,应用点杂交(Dot Blot)实验进行了验证.结果脑膜瘤基因表达谱样本聚类结果与其样本的病理级别存在高度相关性;筛选出5条基因,建立了3个判别函数方程,根据它们的表达情况可以较准确的判断脑膜瘤的病理级别.结论脑膜瘤目前的病理分级标准有分子生物学基础;根据脑膜瘤基因表达谱可建立判断脑膜瘤病理分级的诊断芯片数学模型.