柑橘速衰病毒CP基因的序列变异性分析

• 作者: 张建坤 洪霓 王国平
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柑橘速衰病毒(CTV) CP基因 RT-PCR 单链构象多态性(SSCP) 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 259-264
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 字数: 4337字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2006.02.023

摘要

以提取的宽皮橘(Citrus reticulata Blanco)总RNA为模板,用RT-PCR扩增柑橘速衰病毒(Citrus tristeza virus,CTV)的外壳蛋白基因(CP),扩增产物经克隆与测序证实,来自湖南道县和江西崇义的3份样品(HN、JX-1和JX-2)都感染了CTV.单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析表明,来源于3份样品的CTV的CP基因在遗传上存在变异,其中来自HN和JX-1的CTV的CP基因序列仅含有1种序列类型,而来自JX-2的CP基因序列群体则含有2种主序列.序列分析表明,克隆HN-K与葡萄牙分离物28C和以色列茎陷分离物VT的同源性均为98%;克隆JX-1-1与印度茎馅分离物Pune和Bangalore的同源性分别达98%和99%;克隆JX-2-7、JX-2-17与日本苗黄分离物NUagA和美国加利福尼亚严重茎陷分离物SY568相比,同源性为97%%～98%;4个克隆与佛罗里达速衰分离物T36、弱毒分离物T30和西班牙弱毒分离物T385的同源性仅有91%%～93%.系统发育分析显示,4个中国克隆分属3个不同的族,与地理起源不同的茎陷或苗黄分离物的亲源关系更近,而与速衰和弱毒分离物的亲源关系更远,暗示CTV的地理起源与其核苷酸距离之间没有相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王国平	华中农业大学植物科学技术学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室	61	723	16.0	25.0
2	洪霓	华中农业大学植物科学技术学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室	53	460	12.0	19.0
3	张建坤	华中农业大学植物科学技术学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室	3	23	3.0	3.0