简单INDEL编码与其它空位编码方法的比较

• 作者: 史卫峰 沈佐锐 黄大卫
• 来源期刊: 动物分类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 空位 简单indel编码 丢失的数据 第5性状 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 页码范围: 88-94
• 页数: 7页
• 分类号: Q966
• 字数: 5362字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0739.2006.01.013

摘要

不同的系统发育重建算法以不同的方式编码空位,但是不同的编码方式对系统发育分析结果的影响并不清楚.介绍了一种新的空位编码方式--简单indel编码,并将它与将空位编码成丢失的数据和编码成第5性状作了比较.统计分析表明,简单indel编码的确比将空位编码成丢失的数据更有效,但是与将空位编码成第5性状相比两者结果差异不大.而且,随着空位含量的降低,简单indel编码发挥的作用也减少.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄大卫	中国科学院动物研究所	52	608	11.0	24.0