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摘要:
序列相关扩增多态性(SRAP)是近年来发展起来的一种新型分子标记系统,它具有简便、中等产量、高共显性、重复性、易于分离条带及测序等优点,最大的特点是它针对的是基因的阅读框区域(ORFs).SRAP标记中,引物的设计是关键,它是基于两个引物的扩增,上游引物长17 bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18 bp,特异扩增的是内含子及启动子区域,由于个体不同以及物种之间的内含子、启动子之间间隔长度不同而产生多态性.两个引物均由5'端14~15 bp的核心序列,和3'端3个选择性碱基组成,其中核心序列又由长为10~11 bp的无特异性的填充序列以及CCGG(正向引物中),或AATT(反向引物中)组成.且正向和反向引物中的填充序列必须不同.扩增的过程采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后30~35个循环则为50℃,扩增后的DNA片段可用聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳分离,EB、银染或放射自显影检测.目前SRAP已开始在植物种质资源鉴定评价、种缘进化关系、遗传图谱构建、基因定位、重要性状标记以及比较基因组学方面得到成功应用.
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文献信息
篇名 SRAP分子标记及其应用概述
来源期刊 热带医学杂志 学科 医学
关键词 SRAP 分子标记 ORFs PCR
年,卷(期) 2006,(4) 所属期刊栏目 综述
研究方向 页码范围 467-469,封四
页数 4页 分类号 R392.11
字数 4091字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-3619.2006.04.041
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 林瑞庆 华南农业大学兽医学院寄生虫学教研室 127 1096 19.0 26.0
2 朱兴全 华南农业大学兽医学院寄生虫学教研室 127 1286 20.0 27.0
3 李巧燕 华南农业大学兽医学院寄生虫学教研室 1 113 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
SRAP
分子标记
ORFs
PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带医学杂志
月刊
1672-3619
44-1503/R
大16开
广州市中山二路74号中山医学院
1979
chi
出版文献量(篇)
7964
总下载数(次)
21
总被引数(次)
32495
相关基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:National Basic Research Program of China
官方网址:http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:农业
广东省自然科学基金
英文译名:Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:研究团队
学科类型:
论文1v1指导