微卫星DNA标记探讨镜鲤的种群结构与遗传变异

• 作者: 全迎春 孙效文 曹鼎辰 李大宇 梁利群
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 微卫星 群体多样性 镜鲤 分子标记
• 年，卷（期）: 2006,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1541-1548
• 页数: 8页
• 分类号: Q5
• 字数: 5284字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2006.12.010

摘要

采用30个微卫星分子标记, 对5个镜鲤群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测, 根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离, 以χ2检验估计Hardy-Weinberg平衡, 以近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化.同时, 使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA聚类图, 并进行bootstrap自举检验验证进化树的可靠性.在德国镜鲤选育系(Scattered Cyprinus carpio L.)和来自4个不同养殖场(松浦、东岗、奉城和辽中)的德国镜鲤群体中共检测到7 083个扩增片段, 长度在102 ～ 446 bp之间, 在群体内扩增出等位基因1～16个不等, 共计356个等位基因.结果表明: (1)5个群体检测的有效等位基因数在1.07～12.30个不等, 平均多态信息含量为0.74、0.74、0.69、0.75和0.75, 无偏期望杂合度的平均值为0.74、0.78、0.70、0.76和0.78, 说明这几个群体属于高度多态, 遗传多样性水平较高.(2)群体间相似系数在0.52以上, 相似性较高.聚类分析显示, 东岗、奉城和辽中3个养殖场的德国镜鲤群体聚类成一个分支, 而德国镜鲤选育系与松浦群体聚类成另一分支.聚类的先后与它们在地理分布上距离远近有一定的相关性.(3)在与功能基因相关的多个微卫星基因座位上, 扩增产物呈现不同程度的缺失现象, 这些无效等位基因的产生可能与结构基因在育种中受到人工选择的影响较大有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	全迎春	黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室	4	200	4.0	4.0
5	孙效文	黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室	14	301	7.0	14.0
6	李大宇	黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室	4	157	4.0	4.0
10	曹鼎辰	黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室	1	59	1.0	1.0