水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位

• 作者: 余增亮 刘斌美 吴敬德 吴跃进 张瑛 程灿 童继平
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 水稻 半矮秆突变体 显性基因 SCAR 基因定位
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 449-454
• 页数: 6页
• 分类号: S511
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2006.03.022

摘要

粳稻品系Y98149是从离子束诱变的后代中获得的显性半矮秆突变体,与野生型Y98148是1对株高近等基因系.将已经获得的3个与水稻显性半矮秆基因紧密连锁的RAPD标记分别克隆、测序,根据测序结果设计了3对特异性PCR引物,成功地将RAPD标记S1041525、S1076549和S1272403转化成更稳定的SCAR标记SCS1041498、SCS1076510和SCS1272388.通过Y98148×Y98149的F2代分离群体的分析,这3个SCAR标记与显性半矮秆基因的遗传距离分别为12.6 cM、7.5 cM和16.3 cM,且位于基因的同一侧.序列同源性比较表明,标记S1272403为单拷贝,其核苷酸序列与水稻第7染色体上2个BAC克隆B1249D05(AP006451)和OJ1212-C12(AP005604)同源性为99%,B1249D05与OJ1212-C12有23 kb的重叠区域,标记S1272403位于这个重叠区域,据此初步将显性半矮秆基因定位,为进一步精确定位和图位克隆奠定了基础.