红鳍东方鲀基因组微卫星特征分析

• 作者: 宫庆礼 崔建洲 杨官品 申雪艳 顾谦群
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 红鳍东方鲀(Takifugu rubripes) 微卫星 基因组
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 工程技术
• 页码范围: 249-254,272
• 页数: 7页
• 分类号: Q754
• 字数: 5167字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2006.02.015

摘要

对河豚基因组微卫星分布特征进行研究,在约365Mb基因组序列中共找到49 647个微卫星序列,平均每隔7 351个碱基就有1个.微卫星序列长度主要分布在20～60个碱基的长度范围内.全部微卫星序列重复区长度(2 802 374bp)占整个基因组的比例为0.77%.两碱基重复类型数目最多,为35 339个,占总数的71.30%;其次是四碱基类型,6 837个,占13.77%;再次分别是三碱基类型3 548个,占7.14%,五碱基类型1 856个,占3.73%,六碱基类型1 605个,占3.23%,单碱基类型最少,共402个,占0.80%.按降序排列,出现最多的前20个微卫星重复类别为:CA, TG, GT, AC, GA, CT, TC, TA, AG, AT, TCCA, ATCC, TCTG, GATG, ATCT, CATC, TGGA, ATGG, GATA, GAG,占全部微卫星序列的75.21%.在河豚基因组中未发现GC微卫星序列的存在.与其它生物基因组中微卫星分布特征相比,河豚基因组具有更高的简洁性.本研究将为研究河豚微卫星标记、研究其群体遗传多样性,进行不同基因组的比较研究提供基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾谦群	中国海洋大学生命科学与技术学部	62	540	15.0	22.0
2	宫庆礼	中国海洋大学生命科学与技术学部	52	591	14.0	22.0
3	杨官品	中国海洋大学生命科学与技术学部	77	830	17.0	25.0
4	崔建洲	中国海洋大学生命科学与技术学部	13	236	9.0	13.0
5	申雪艳	中国海洋大学生命科学与技术学部	8	159	6.0	8.0