总状毛霉(Mucor racemosus)甲壳素脱乙酰酶全长cDNA的克隆及序列分析

• 作者: 周培根 蒋霞云 邹曙明
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 快速扩增cDNA末端 甲壳素脱乙酰酶 总状毛霉 系统发生
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 981-985
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 3713字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2006.06.030

摘要

用保守的特异引物进行PCR扩增,结合RACE技术,分离和克隆到了总状毛霉(Mucorracemosus)甲壳素脱乙酰酶(CDA)的全长cDNA,并进行了全序列测定,提交GenBank登陆号DQ538514.研究结果表明:(1)总状毛霉CDA基因全长为1 506 bp,包括67 bp5′非翻译区,1 344 bp阅读框以及95 bp3′非翻译区,3′非翻译区包含Poly (A)加尾信号AATAAA.总状毛霉的CDA基因共编码448个氨基酸,在该基因中部还包含一个144氨基酸的多糖脱乙酰酶结构域,约占CDA基因全长的32%.(2)总状毛霉CDA基因与其它相近种米根霉(Rhizopus oryzae)、卷柄根霉(Rhizopus circinans)的CDA1和CDA2、鲁氏毛霉(Mucor rouxii)、卵形孢球托霉(Gongronella butleri)、匍枝根霉(Rhizopus stolonifer)、布拉克须霉(Phycomyces blakesleeanus)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的CDA1和CDA2的基因序列同源性分别为:75%、58%、56%、56%、48%、39%、39%、17%和16%;相应的氨基酸序列的同源性分别为:69%、57%、59%、55%、47%、30%、32%、18%和21%.表明CDA基因在不同的真菌中有着不同的亲缘关系.(3)根据总状毛霉CDA基因的氨基酸序列构建的不同真菌的系统树,与采用经典分类法构建的系统树基本一致.(4)通过生物信息学的方法,预测该基因所编码的蛋白质三级结构,验证了该蛋白质具有甲壳素脱乙酰酶完整的功能性结构,并包含一个多糖脱乙酰酶结构域,两者具有相似的空间结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周培根	上海水产大学食品学院	61	1169	21.0	30.0
2	蒋霞云	上海水产大学食品学院	7	114	4.0	7.0
3	邹曙明	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	14	398	10.0	14.0