芯片技术用于APC基因启动子甲基化定量检测

• 作者: 张丽霞 张寄南 潘世扬 王贤 程璐 陆祖宏 陈丹 魏源华
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: APC基因 甲基化 芯片 定量
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 研究生园地
• 页码范围: 199-202
• 页数: 4页
• 分类号: Q789
• 字数: 2708字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-764X.2006.03.014

摘要

目的研制抑癌基因APC启动子1A的甲基化定量检测芯片,对临床标本进行初步定量检测分析.方法采用脐带血DNA克隆体作为阴性、阳性质控品建立芯片,提取6例健康人的肺组织DNA、6例肺癌患者的肺组织和癌组织DNA,进行亚硫酸盐化学修饰,以甲基化特异性引物进行基因扩增,与探针杂交检测,并进行甲基化特异性序列分析.结果甲基化阳性、阴性质控品的芯片检测与测序结果吻合.687、707、714、719和726共5个位点的荧光强度标准曲线的R2为0.93～0.99.687、707、714、719和726共5个位点非甲基化的检测范围:(0±8.7)%、(0±17.6)%、(0±17)%、(0±13)%、(0±8)%;甲基化杂合型的检测范围:(50±3.6)%、(50±6.9)%、(50±3.5)%、(50±8.5)%、(50±7.3)%.标本的芯片检测与测序结果一致.结论本研究首次建立了以微阵列技术为基础的APC基因启动子甲基化定量检测芯片.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程璐	东南大学生物科学与医学工程系吴健雄实验室	16	71	6.0	7.0
2	陆祖宏	东南大学生物科学与医学工程系吴健雄实验室	166	1602	19.0	33.0
3	潘世扬		85	701	14.0	20.0
4	张寄南		85	506	11.0	19.0
5	张丽霞		39	299	10.0	15.0
6	陈丹		20	144	8.0	11.0
7	魏源华		6	89	5.0	6.0
8	王贤		2	15	2.0	2.0