SON-PCR扩增抗禾谷孢囊线虫基因LRR区及序列分析

• 作者: 余懋群 刘毅 吴芳 潘志芬 翟旭光 邓光兵
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禾谷孢囊线虫 抗性基因 SON-PCR LRR区 克隆与序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 565-568
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 2678字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2006.04.025

摘要

根据与抗禾谷孢囊线虫(Heterodera avenae)基因Cre3的NBS(nucleotide binding site)编码区高度同源的Rccn4序列设计3条3'端嵌套引物,采用SON-PCR(single oligonucleotide nested PCR)方法从含有源于易变山羊草(Aegilops varibilis)的抗禾谷孢囊线虫基因的小麦(Triticum aestivum)-易变山羊草染色体小片段易位系E-10中获得了长度为1264 bp的Rccn-L(GenBank登录号为DQ124933),它将Rccn4 3'端延伸了1209 bp,编码区长1026 bp,含一个不完整的开放阅读框,一个终止密码子,没有起始密码子和内含子结构.其编码一个342个氨基酸残基的蛋白质,含有NBS(nucleotide binding site)-LRR(1eucine-rich repeats)类抗性基因LRR区的保守模体,呈现XXLXXLXXL重复.首次将SON-PCR方法成功地运用到植物基因组学研究中,为植物基因克隆又提供一方法.