小麦EST数据批量分析平台的构建与应用

• 作者: 庞晓斌 昌小平 景蕊莲 李彦舫 毛新国
• 来源期刊: 麦类作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 EST数据 批量分析 生物信息学 水分胁迫 cDNA
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 软件开发
• 页码范围: 146-151
• 页数: 6页
• 分类号: S5
• 字数: 4442字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-1041.2006.03.031

摘要

为进行EST数据批量分析,构建了EST/cDNA序列数据高通量、自动化分析平台.该平台基于Linux操作系统,主要由一些免费软件和perl程序构成,具有自动组装EST序列、查找同源基因、注释基因功能,同时具有进行基因分类等功能.利用该平台对小麦水分胁迫诱导表达的5个cDNA文库的6 733条EST序列进行全面分析,初步建立了小麦水分胁迫诱导的基因表达谱.检测结果表明,小麦EST数据批量分析平台为批量EST序列的生物信息学分析提供了实用、便捷工具.