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摘要:
目的 进一步了解新的成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因特征.方法 利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增新的成人腹泻轮状病毒J19株的VP1基因,克隆至pMD18-T中并进行测序.利用DNAStar和PHYLIP软件包进行序列之间的比较分析并绘制系统发生树.结果 J19株的VP1基因为基因1,全长3538个核苷酸,编码1167个氨基酸.氨基酸序列同源性分析表明J19株的VP1蛋白序列对B组轮状病毒IDIR株的一致性为55.7%,对A组轮状病毒SA11株和C组轮状病毒Bristol株的一致性分别为20.4%、19.2%.对J19株的VP1蛋白序列的遗传进化分析表明,J19株在系统发生树上的位置是靠近外群蛋白并靠近A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支.结论 J19株的VP1蛋白序列与其他轮状病毒的VP1蛋白序列存在显著差异.J19株可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一.
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文献信息
篇名 成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因序列分析
来源期刊 中华微生物学和免疫学杂志 学科 医学
关键词 新成人腹泻轮状病毒 J19株 基因 克隆 序列分析
年,卷(期) 2006,(8) 所属期刊栏目 病毒学
研究方向 页码范围 739-742
页数 4页 分类号 R3
字数 3252字 语种 中文
DOI 10.3760/j:issn:0254-5101.2006.08.018
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新成人腹泻轮状病毒
J19株
基因
克隆
序列分析
研究起点
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期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
月刊
0254-5101
11-2309/R
大16开
北京市经济技术开发区经海二路38号
2-55
1981
chi
出版文献量(篇)
5865
总下载数(次)
10
总被引数(次)
26456
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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