siRNA对SGC7901/VCR细胞mdr1基因沉默效果的影响因素分析

• 作者: 吴景兰 张钦宪 朱晓燕 王峰 高福莲
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 小分子干扰RNA mdr1基因 SGC7901/VCR细胞 基因沉默效果 siRNA设计
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 151-155
• 页数: 5页
• 分类号: R73-36+2
• 字数: 4067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2006.03.005

摘要

目的分析siRNA沉默人胃癌SGC7901/VCR细胞mdr1基因效果的相关因素.方法设计并体外转录合成4条靶向mdr1的siRNA(mdr1si326、mdr1si1513、mdr1si2631和mdr1si3071),转染SGC7901/VCR细胞,用RT-PCR和免疫印迹检测mdr1mRNA和P-gp的表达、流式细胞仪检测细胞内阿霉素的蓄积和MTT法检测细胞对阿霉素的敏感性,综合这4方面结果评价4条siRNA的沉默效果情况;用分子生物学软分析siRNA沉默效果的影响因素.结果沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdr1si2631靶序列编码P-gp的跨膜区而且自身无茎和袢;沉默效果较差的mdr1si3071和最差的mdr1si1513 靶序列编码P-gp的胞内区,前者自身成茎和成袢.沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdr1si2631靶序列在靶位点和靶位点外间有较少的碱基配对和氢键.siRNA的沉默效果与siRNA 3'5'端3个碱基中的A/U数量、N1和N19、GC含量间无规律可循.结论 siRNA沉默SGC7901/VCR细胞mdr1的效果与靶序列的结构关系密切.