利用水稻C0t-1 DNA和基因组DNA对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组的比较分析

• 作者: 何光存 吴士筠 蓝伟侦 覃瑞
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: C0t-1 DNA CGH 核型 药用野生稻 疣粒野生稻
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·分子遗传学
• 页码范围: 1083-1090
• 页数: 8页
• 分类号: S5
• 字数: 6349字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0578-1752.2006.06.001

摘要

[目的]研究中高度重复序列在稻属不同物种基因组进化中的作用.[方法]用栽培稻C0t-1 DNA和基因组DNA(gDNA)作为探针,分别对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻进行荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交(CGH).[结果]C0t-1 DNA覆盖栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组比例(%)和大小(Mb)分别为47.10±0.16,38.61±0.13,44.38±0.13和212.33±1.21,269.42±0.89以及532.56±1.68.栽培稻gDNA在药用野生稻和疣粒野生稻基因组中的覆盖率约为91.0%和93.6%,含量分别约为634 Mb和1123 Mb,各有365 Mb和591 Mb不属于源自栽培稻基因组的中高度重复序列,未被栽培稻gDNA所覆盖的部分,分别为64 Mb和78 Mb左右.此外,以C0t-1 DNA的组成为依据,对这3个种核型进行了同源性聚类.[结论]稻属中度和高度重复序列和功能基因一样,在不同种中也存在着高度同源性和保守性,并在进化过程中得以保存下来.药用野生稻和疣粒野生稻基因组增大的重要原因之一,可能是基因组中度和高度重复序列加倍的结果,药用野生稻这种序列扩增相对疣粒野生稻要缓和得多.另外,这两个野生种在长期进化过程中,由于存在加倍、重排和基因选择性丢失等现象,形成了具有自己种的特异性的基因组成分.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	覃瑞	中南民族大学生命科学学院国家民委生物技术重点实验室	82	451	12.0	18.0
3	吴士筠	中南民族大学生命科学学院国家民委生物技术重点实验室	36	379	11.0	18.0
6	何光存	武汉大学生命科学学院植物发育生物学教育部重点实验室	46	983	15.0	30.0
7	蓝伟侦	中南民族大学生命科学学院国家民委生物技术重点实验室	6	84	5.0	6.0