基于小波分析的膜蛋白跨膜区预测方法研究

• 作者: 李宏 肖玮
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 膜蛋白 跨膜螺旋区 小波分析 阀值
• 年，卷（期）: 2006,（12）
• 所属期刊栏目: 学术探讨
• 页码范围: 82-84,99
• 页数: 4页
• 分类号: TP301
• 字数: 2748字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-8331.2006.12.025

摘要

文章基于离散小波变换提出了一种用于预测膜蛋白跨膜区数目和位置的新方法.以代码为1Q16的膜蛋白为例,通过选择合适的小波函数和分解级数,对1Q16对应的疏水值信号进行消噪处理,能够准确预测出跨膜区的数目.根据文章提出的膜蛋白家族阀值表,为膜蛋白数据选择合适的阀值,可以准确地预测出1Q16包含的跨膜区的具体位置.我们从膜蛋白数据库MPtopo中随机抽取90条膜蛋白数据作为测试集(含跨膜区335个),跨膜区预测准确率、膜蛋白序列预测准确率分别达到94.1%、88.9%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宏	中南大学信息科学与工程学院	73	514	13.0	19.0
2	肖玮	中南大学信息科学与工程学院	7	2	1.0	1.0