原文服务方: 计算机应用研究       
摘要:
Motif在转录和后转录水平的基因表达调控中起着重要的作用.目前,识别Motif的算法和相应的软件已有不少,但是却鲜有对各种算法及软件性能共同评测的研究和报告.介绍了算法的分类以及三种常见的Motif识别算法Wordup,MM和Gibbs采样,并对AlignACE,MEME,MotifSampler,Weeder等13种Motif寻找软件进行性能比较分析.通过生物学意义的研究和性能比较结果可以得出:由于唯有Weeder算法考虑了Motif保守核心位置,因而它在各种软件中识别效果较好;大部分算法只考虑简单而且短的Motif,所以各种软件对酵母菌这种单细胞生物的Motif识别性能比多细胞生物要高.
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文献信息
篇名 Motif识别算法简介及软件性能研究
来源期刊 计算机应用研究 学科
关键词 Motif Wordup MM Gibbs采样
年,卷(期) 2006,(10) 所属期刊栏目 研究探讨
研究方向 页码范围 66-69
页数 4页 分类号 TP301.6
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-3695.2006.10.024
五维指标
传播情况
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引文网络
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1992(1)
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研究主题发展历程
节点文献
Motif
Wordup
MM
Gibbs采样
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
计算机应用研究
月刊
1001-3695
51-1196/TP
大16开
1984-01-01
chi
出版文献量(篇)
21004
总下载数(次)
0
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:http://www.863.org.cn
项目类型:重点项目
学科类型:信息技术
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