日本百脉根γ-生育酚甲基转移酶基因的电子克隆及进化分析

• 作者: 孟宪萍 李晓晓 李雅轩 胡英考 蔡民华
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 日本百脉根 γ-生育酚甲基转移酶 电子克隆 EST
• 年，卷（期）: 2006,（24）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 6457-6459
• 页数: 3页
• 分类号: Q94-333
• 字数: 2176字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2006.24.025

摘要

根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法,以拟南芥γ-生育酚甲基转移酶cDNA序列为信息探针,在GenBank的HTGs数据库中找到与之高度同源的日本百脉根基因组DNA序列--LiT44D21克隆.通过GENSCAN分析及序列拼接得到日本百脉根γ-TMT基因的cDNA序列,GenBank的登陆号为DQ013360.用该序列对GenBank中的est-others进行相似性搜索,获得了44条日本百脉根的EST序列,经拼接后发现与基因组预测的基因序列一致,表明该基因是真实存在和表达的.该cDNA序列长为1077bp,具有完整的开放阅读框架(1～1 077 bp).推测编码蛋白为358个氨基酸,该蛋白序列与大豆、水稻、小麦、拟南芥、油菜、苜蓿和衣藻等物种的γ-TMT蛋白质序列进行了同源性比较分析,具有很高的同源性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡英考	首都师范大学生命科学学院	41	609	15.0	23.0
2	李雅轩	首都师范大学生命科学学院	43	499	14.0	20.0
3	蔡民华	首都师范大学生命科学学院	31	341	11.0	17.0
4	李晓晓	首都师范大学生命科学学院	5	43	3.0	5.0
5	孟宪萍	首都师范大学生命科学学院	5	40	4.0	5.0