Ⅰ型人类免疫缺陷病毒的核酸异质性及准种特点的研究

• 作者: 周伯平 张阳德 徐六妹 李丽雄 王火生 王辉 陆坚 黄慧谦
• 来源期刊: 中国现代医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒 变异 准种 env基因
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 810-812
• 页数: 3页
• 分类号: Q243
• 字数: 1705字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-8982.2006.06.003

摘要

目的研究Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)膜蛋白基因(env)的准种与变异特点.方法采用巢式PCR方法对5例艾滋病患者血浆HIV-1env基因C2～V3区进行PCR扩增,产物经纯化后克隆至pMD-18T载体中,每例患者分别挑取5～8个克隆,共34株,完成阳性克隆的鉴定、抽提纯化和测序,将获得的DNA序列及氨基酸序列进行分析,并计算其氨基酸同源替换率(ds)与非同源替换率(dn)的比值.结果同一患者体内HIV准种株平均为83.5%,各克隆株之间的核苷酸同源性在88%～99%之间;不同患者之间的核苷酸同源性在75%～91%;34株序列的V3区平均变异频率明显高于C2～C3区(P＜O.05);而V3区和C2～C3区的ds/dn比值均＞1.结论艾滋病患者体内有大量HIV准种存在,基因的变异在V3区发生较频繁,免疫选择压力在该区变异中不起主要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张阳德	中南大学生物医学工程研究院	556	4187	26.0	40.0
2	李丽雄	广东省深圳市东湖医院检验科	6	11	2.0	3.0
3	王辉	广东省深圳市东湖医院检验科	28	121	6.0	10.0
4	徐六妹	广东省深圳市东湖医院检验科	15	23	3.0	4.0
5	黄慧谦	广东省深圳市东湖医院检验科	7	8	2.0	2.0
6	王火生	广东省深圳市东湖医院检验科	9	33	4.0	5.0
7	陆坚	广东省深圳市东湖医院检验科	11	39	4.0	6.0