12种石鲈科鱼类线粒体16S rRNA基因的部分序列分析

• 作者: 任岗 徐忠能 林小涛 章群 钱开诚
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 石鲈科 线粒体16S rRNA 基因 RNA二级结构 序列分析 系统发育
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 48-52
• 页数: 5页
• 分类号: Q959
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2007.03.008

摘要

分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16S rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区.结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息.从序列的Jukes-Cantor遗传距离结果看,石鲈科胡椒鲷属Plectorhynchus、矶鲈属Parapristipoma、石鲈属Hapalogenys、髭鲷属Pomadasys、Haemulon属5个属属间的差异水平都接近或超过了其与外类群科间的差异水平.从构建的ME系统发育树结果看,石鲈科鱼类分成二大分支,未能形成单一类群.在亲缘关系上,胡椒鲷属和矶鲈属较近,石鲈属和Haemulon属较近,髭鲷属与其它4个属较远,髭鲷属在鲈亚目中的分类地位可能应提高到科的水平.初步确定研究中选用的16S rRNA基因片段基本适用于石鲈科属间和属内种间关系的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章群	暨南大学水生生物研究所	86	843	17.0	23.0
2	林小涛	暨南大学水生生物研究所	128	2532	28.0	44.0
3	任岗	暨南大学水生生物研究所	19	120	6.0	10.0
7	钱开诚	暨南大学水生生物研究所	8	133	7.0	8.0
8	徐忠能	暨南大学水生生物研究所	1	24	1.0	1.0