大额牛Myf-5基因克隆、序列分析及其分子系统进化研究

• 作者: 罗虹 胡汉傈 金双 钟金城 陈玉红 马志杰
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大额牛 Myf-5基因 克隆 分子系统进化
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1279-1289
• 页数: 11页
• 分类号: S823.2
• 字数: 7394字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2007.12.002

摘要

对大额牛Myf-5基因进行PCR扩增、T-A克隆和序列分析,并应用DNAMAN4.0、BioEdit 4.8.10、DnaSP4.10、Mega3.1等生物信息学软件同普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼9个物种相应基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对分析,在此基础上采用NJ、ME和UPGMA法对其编码区核苷酸序列构建了分子系统进化树.结果表明:①大额牛Myf-5基因由3个外显子和2个内含子组成,其大小分别为660、76、1 226、852、407 bp;外显子和内含子数与其他9个物种相同,但大小存在较大的差异;外显子与内含子连接区遵循GT-AG基因组成规则.②大额牛与普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼的Myf-5基因编码区核苷酸序列同源性分别为99.0%、90.0%、90.5%、90.5%、87.2%、84.8%、72.9%、64.3%、51.8%,相应的氨基酸序列同源性分别为99.6%、94.9%、94.6%、94.9%、89.9%、88.7%、81.6%、70.4%、56.6%,这说明大额牛与其他9个物种在Myf-5基因的编码区核苷酸和相应氨基酸序列上具有较高的保守性.③用NJ、ME和UPGMA等3种方法聚类构建的分子系统进化树表明,3种方法的聚类结果基本一致,即大额牛与普通牛首先聚为一类,人、黑猩猩、恒河猴也先聚为一类,这两类相聚后再依次同其他物种聚在一起.这与mtDNA、其他功能基因和动物学分类的研究结果一致,表明Myf-5基因适合用于物种间系统进化关系的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟金城	西南民族大学生命科学与技术学院	92	727	16.0	22.0
2	马志杰	青海省畜牧兽医科学院畜牧研究所	41	320	9.0	16.0
3	陈玉红	西南民族大学生命科学与技术学院	6	11	2.0	3.0
4	金双	西南民族大学生命科学与技术学院	3	25	3.0	3.0
5	罗虹	西南民族大学生命科学与技术学院	2	14	2.0	2.0
6	胡汉傈		1	4	1.0	1.0