苏云金杆菌杀虫晶体蛋白活性预测的支持向量机模型

• 作者: 张光亚 林毅 蔡福营
• 来源期刊: 生物工程学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苏云金杆菌 均匀设计 支持向量机 杀虫晶体蛋白 杀虫活性预测
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 127-132
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 4601字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3061.2007.01.022

摘要

藉均匀设计(UD)方法,构建了苏云金杆菌(Bt)杀虫晶体蛋白氨基酸组成特征与其杀虫活性之间关系的支持向量机(SVM)模型.当惩罚系数为0.01、epsilon值为0.2、gamma值为0.05、域值为0.5时,该模型对Bt杀虫晶体蛋白杀虫活性的预测平均准确率达73%.