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摘要:
采用磁珠富集法构建黄鳍鲷(Acanthopagrus latus Houttuyn)基因组微卫星富集文库.共挑选60个克隆进行测序,分析发现58个克隆分别含(GA)n或(CA)n两碱基重复单元.进一步通过序列比对,最终获得41个具有特异微卫星序列的阳性克隆.其中,23个克隆含有(GA)n或(CT)n两碱基重复序列,17个克隆含有(GT)n或(CA)n重复序列,另1个含有以上两种重复类型.获得的微卫星序列中,单一型及间断型序列各有20条,另有1条属于复合型序列.序列长度为117~512 bp,平均259 bp.微卫星核心序列两碱基重复5到38次,绝大多数序列重复次数大于10.基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了3对能够在黄鳍鲷基因组有效扩增的微卫星引物.本研究旨为进一步开展黄鳍鲷分子育种及资源评价分析提供基础资料.
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文献信息
篇名 黄鳍鲷基因组微卫星的分离
来源期刊 中国水产科学 学科 农学
关键词 黄鳍鲷 基因组 微卫星
年,卷(期) 2007,(2) 所属期刊栏目 研究简报
研究方向 页码范围 321-325
页数 5页 分类号 S9
字数 3932字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:1005-8737.2007.02.022
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 朱彩艳 中国水产科学研究院南海水产研究所 20 194 9.0 13.0
2 苏天凤 中国水产科学研究院南海水产研究所 58 1015 17.0 29.0
3 江世贵 中国水产科学研究院南海水产研究所 100 1501 22.0 31.0
4 夏军红 中国水产科学研究院南海水产研究所 12 143 7.0 11.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
黄鳍鲷
基因组
微卫星
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国水产科学
月刊
1005-8737
11-3446/S
大16开
北京市永定路南青塔村150号
18-250
1994
chi
出版文献量(篇)
3187
总下载数(次)
1
总被引数(次)
54530
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导