巴西橡胶树HbMYC1基因的克隆及序列分析

• 作者: 田维敏 程汉 高静 黄华孙
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 巴西橡胶树 RACE MYC 茉莉酸
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 26-31
• 页数: 6页
• 分类号: S794.1|Q781
• 字数: 2649字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2007.04.006

摘要

从GenBank中搜索到1条来自橡胶树的MYC(Myelocytomatosis)家族基因EST序列,以该序列为保守区,通过RACE技术获得了该基因全长cDNA序列,共1 817 bp.通过BLAST工具搜索GenBank数据库,结果表明,该cDNA序列同其他植物的MYC家族基因高度同源,认为该cDNA序列为橡胶树MYC家族成员.利用GenScan和Clastal X对该序列进行分析,推测其编码区长度为1 428 bp,编码476个氨基酸.生物信息学分析结果表明,巴西橡胶树的MYC基因编码的氨基酸序列与其他物种的相似性很高,同时推导的蛋白质序列中还存在着1个螺旋-环-螺旋的DNA结合区域和1个核定位信号,表明克隆到的基因是1个MYC家族成员的转录因子.