1981～2005年中国H1N1甲型流感病毒血凝素基因的HA1演变特征

• 作者: 张家淮 张烨 徐红 舒跃龙 蓝雨 赵翔 郭俊峰
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: H1N1甲型流感病毒 HA1 种系发生树
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 专题报道 流感病毒研究
• 页码范围: 350-355
• 页数: 6页
• 分类号: R373.1
• 字数: 3369字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2007.05.003

摘要

为了解1981～2005年我国H1N1甲型流感病毒血凝素基因的HA1演变特征,选取H1N1甲型流感病毒370株,提取病毒RNA,经逆转录和聚合酶链反应扩增HA1并测序,测定的序列用生物信息软件分析,与GenBank中相关序列比较,并对推导的编码氨基酸序列进行基因特性分析.结果表明:HA1氨基酸的变异表现为抗原决定簇4个区均有变异,Sb区和Ca区变化较大;HA1受体结合位点(RBS)的前壁130环的第134位赖氨酸从1991年起在部分毒株HA1序列上开始缺失,以后缺失株逐步增多,自2000年起测定的所有毒株上该氨基酸全部缺失,同时这些缺失株的第137位氨基酸也全部由苏氨酸替换为丝氨酸;糖基化位点从增多到减少,最后稳定在7个;1981～2004年我国H1N1甲型流感病毒血凝素HA1编码的氨基酸在种系发育树上同年代基本呈现集中分布,与时间和地域无关,2005年毒株分成两个分支在时间上有明显差异.