柳珊瑚4种不同DNA提取方法的比较研究

• 作者: 何建国 张俊彬 李秀保 杨泽民 章群 谢数涛 黄晖
• 来源期刊: 海洋通报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 柳珊瑚 DNA提取 方法
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 仪器与方法
• 页码范围: 100-104
• 页数: 5页
• 分类号: P745
• 字数: 4562字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6392.2007.02.015

摘要

通过 2 种样品前处理方式和 4 种不同的 DNA 提取方法相结合,提取橘色刺柳珊瑚(Echinogoria aurantiaca) 基因组DNA,并对其 18S rRNA 基因进行了克隆和测序.实验结果表明,对于 2 种样品前处理方式,采用纯酒精进行样品前处理比 PBS(磷酸缓冲液) 进行样品前处理效果要好.在 4 种不同的 DNA 提取方法中,以 CTAB(十六烷基三甲基溴化铵) 法提取基因组 DNA 效果最好,其余 3 种方法如 PVP(聚乙烯基吡咯烷酮) 法、高盐法和酚/氯仿法的提取效果较差.并且不同样品的钙质沉淀对 DNA 都有一定程度的吸附.最后,通过 PCR 扩增、克隆测序得到橘色刺柳珊瑚 18S rRNA 基因序列(AY962532).BLAST 软件进行序列比对表明橘色刺柳珊瑚与弱柳珊瑚(Leptogorgia chilensis) 的 18S rRNA 基因(AF052928) 同源性最高,为 98.79 %.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章群	暨南大学水生生物研究所	86	843	17.0	23.0
2	何建国	中山大学生命科学院	127	2323	26.0	41.0
3	谢数涛	暨南大学水生生物研究所	33	328	10.0	16.0
4	黄晖	中山大学生命科学院	4	112	4.0	4.0
6	杨泽民	暨南大学水生生物研究所	7	63	5.0	7.0
7	张俊彬	中科院南海海洋研究所	3	13	2.0	3.0
10	李秀保	中科院南海海洋研究所	2	12	2.0	2.0