湖南沙子岭猪SLA-DR基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 唐医亚 王维 薛立群 邢晓为 黄生强
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 医学
• 关键词: 猪白细胞抗原 沙子岭猪 基因克隆 异种移植
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1491-1496
• 页数: 6页
• 分类号: R3
• 字数: 4565字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2007.12.013

摘要

为了克隆湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因,分析SLA基因特性和抗原多态性,评价湖南沙子岭猪在异种移植中的应用前景奠定基础.应用RT-PCR分别扩增湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因,鉴定后克隆到PUCm-T载体并进行测序,用NCBI中的BLAST和ExPASY中相关软件进行生物信息学分析.得到的湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因特异性基因片段,大小分别为1 177 bp和909 bp.生物信息学分析发现,所扩增的SLA-DRA和SLA-DRB基因片段均包含完整的开放阅读框,分别编码252和266个氨基酸残基.将湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因在GenBank登录,登录号分别为EF143987和EF143988.同源性分析发现,湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB与人类相应的DRA、DRB相比,核苷酸序列同源性分别为83%和83%,编码氨基酸同源性分别为83%和79%.与GenBank登录的其他猪种相比,SLA-DRA基因同源性最高可达100%,而SLA-DRB基因具有多态性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王维	中南大学湘雅三医院细胞移植与基因治疗中心	154	756	14.0	18.0
2	邢晓为	中南大学湘雅三医院细胞移植与基因治疗中心	60	303	8.0	13.0
3	黄生强	湖南农业大学动物科学技术学院	73	455	12.0	18.0
4	薛立群	湖南农业大学动物科学技术学院	107	518	12.0	15.0
5	唐医亚	中南大学湘雅三医院细胞移植与基因治疗中心	3	20	3.0	3.0