我国分离的盖塔病毒衣壳蛋白基因和3'非翻译区分子特征研究

• 作者: 付士红 梁国栋 王焕琴 翟友刚
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 盖塔病毒 衣壳蛋白基因 3'非翻译区 核苷酸序列 系统发生树
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 270-275
• 页数: 6页
• 分类号: R373.3
• 字数: 3749字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2007.04.005

摘要

对我国海南省和河北省分离到的3株盖塔病毒(GETV)(M1、HB0215-3和HB0234)进行衣壳蛋白基因和3'UTR区序列测定,并分析比较该病毒的分子生物学遗传特征.首先应用逆转录聚合酶链反应扩增出病毒衣壳蛋白基因和3'UTR片段,纯化后连接到载体中进行测序,然后用Clastal X和DNASTAR软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA软件绘制系统发生树.3株病毒衣壳蛋白基因分别由801、804和804个核苷酸组成,分别编码267、268和268个氨基酸,3株病毒之间核苷酸和氨基酸序列同源性为97.6%～100%和97.8%～100%,与其他GETV分离株核苷酸同源性在95.4%～99.6%之间.3株病毒3'UTR分别由411、401和401个核苷酸组成,发现中国株存在10个(45～54位)核苷酸缺失和2个(64位、148位)特有的核苷酸位点.进化分析表明盖塔病毒之间的进化关系与分离年代相关,中国境内流行的盖塔病毒是相对独立的一个类群.