拟态弧菌安徽分离株外膜蛋白基因OmpU的克隆测序与生物信息学分析

• 作者: 余为一 张传亮 李小飞 李槿年
• 来源期刊: 水利渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟态弧菌 OmpU基因 克隆测序 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 研究探索
• 页码范围: 13-16
• 页数: 4页
• 分类号: Q781
• 语种: 中文

摘要

测序结果显示4株拟态弧菌OmpU基因片段长为849～876bp,编码283～292个氨基酸;拟态弧菌HX4分离株OmpU基因ORF长1 038 bp,编码346个氨基酸.生物信息学分析结果显示,OmpU基因在拟态弧菌安徽分离株之间及其与霍乱弧菌参考株间均具有较高保守性,彼此间核苷酸同源性和氨基酸同源性分别介于82.8%～99.6%和83.3%～100%;拟态弧菌OmpU蛋白N端前22个氨基酸组成信号肽,N末端有1个明显疏水区,并含有多个蛋白激酶磷酸化位点和糖基化位点;OmpU蛋白含有2个明显跨膜域,二级结构中富含β-折叠结构,在蛋白的53～66aa、185～192aa、215～219aa和275～281aa之间可能存在抗原表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余为一		121	1025	17.0	25.0
2	李槿年		98	829	15.0	23.0
3	张传亮		9	91	6.0	9.0
4	李小飞		6	60	4.0	6.0