一种改进的研究蛋白质-蛋白质相互作用的平均势方法

• 作者: 张建 李文飞 王炜 王骏 苏煜
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 基于知识的方法 平均势(PMF) 蛋白质-蛋白质相互作用
• 年，卷（期）: 2007,（21）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 2487-2493
• 页数: 7页
• 分类号: Q5
• 字数: 6070字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074x.2007.21.006

摘要

在原子水平上发展了一种距离相关的用于研究蛋白质-蛋白质相互作用的平均势(potential of mean force, 简称PMF)方法. 与传统理论模型相比, 我们的模型考虑了蛋白质系统的复杂环境因素. 这种改进使得该模型能够给出物理上更合理和准确的势函数形式. 得到这样的势函数是正确描述蛋白质结构及相互作用的前提条件. 而且借助于改进后的方法, 还可以对蛋白质中残基相互作用的空间拓扑规律进行研究. 期望这种改进将促进平均势方法在蛋白质科学其他领域, 如蛋白质折叠识别, 结构预测及热稳定性预测中的应用和发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王炜	南京大学固体微结构物理国家重点实验室南京大学物理系	54	286	9.0	14.0
2	王骏	南京大学固体微结构物理国家重点实验室南京大学物理系	14	120	4.0	10.0
3	苏煜	南京大学固体微结构物理国家重点实验室南京大学物理系	1	1	1.0	1.0
4	李文飞	南京大学固体微结构物理国家重点实验室南京大学物理系	3	5	1.0	2.0
5	张建	南京大学固体微结构物理国家重点实验室南京大学物理系	3	10	2.0	3.0