湾鳄(Crocodylus porosus)线粒体基因组全序列结构分析与鳄类系统发生

• 作者: George Amato 吴孝兵 季学峰 晏鹏 李艳
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 湾鳄 线粒体基因组 系统发生
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 119-128
• 页数: 10页
• 分类号: Q95
• 字数: 506字
• 语种: 中文

摘要

该文测序了湾鳄的线粒体基因组全序列,全长为16,917 bp.湾鳄mtDNA结构与其他脊椎动物相似,由22个tRNA,2个rRNA和13个蛋白质编码基因及1个非编码的控制区(D-loop)所组成.除NADH6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer(UCN)、tRNAGlu、tRNAPro在L-链上编码之外,其余基因均在H-链编码.基因排列顺序与己测序的鳄类一致,这显示了鳄类线粒体基因排列顺序上的保守性.但鳄类线粒体基因排列顺序与脊椎动物的典型排列方式相比,有较大的差异,尤其是tRNAPhe基因的重排、tRNASer-tRNAHis-tRNALeu基因族的排列方式等.湾鳄mtDNA和已测序的鳄类一样,缺失轻链复制起始点(OLR).基于17种鳄mtDNA控制区保守区,采用PAUP4.0最大简约法(Maximum parsimony,MP)构建MP树,邻接法(Neighbor-joining method,NJ)构建NJ树,结果显示:食鱼鳄(Gavialis gangeticus)和假食鱼鳄(Tomistoma schlegelii)聚为一支后再与鳄科(Crocodylidae)的其他物种形成姐妹群,这与基于食鱼鳄和假食鱼鳄的线粒体全序列的分析结果一致,支持将食鱼鳄并入鳄科的观点.结果还支持非洲窄吻鳄(Crocodylus cataphractus)与鳄属(Crocodylus)构成姐妹群,可以单独划分为属的观点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李艳	安徽师范大学生命科学学院	16	70	5.0	8.0
2	吴孝兵	安徽师范大学生命科学学院	117	1430	20.0	33.0
3	晏鹏	安徽师范大学生命科学学院	26	320	9.0	17.0
4	季学峰	安徽师范大学生命科学学院	2	16	2.0	2.0