兔病毒性出血症病毒YL株衣壳蛋白(VP60)基因的克隆和生物信息学分析

• 作者: 张守涛 李传山 杨增岐 杨颖 郭蔼光
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 兔出血症病毒 衣壳蛋白(VP60)基因 RT-PCR 生物信息 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 700-707
• 页数: 8页
• 分类号: S858.2915.3
• 字数: 4495字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2007.07.013

摘要

应用RT-PCR方法从兔出血症病毒(RHDV)西北分离株YL株中克隆出衣壳蛋白VP60基因并测序,YL株是中国西北地区首株被测序的RHDV,测序结果显示VP60基因全长1 740 bp,编码579个氨基酸,测序结果在GenBank中注册(登录号为DQ530363).从GenBank下载全部已发表的40株RHDV序列,运用生物信息学软件分析,构建系统进化树和氨基酸序列同源性表,结果表明,世界不同地区RHDV分离株基因序列虽然非常保守,达到90%以上,但可以分为5个基因群,并且基因型和地域性没有必然联系,中国的分离株除了WX84株外,其它均处于第V基因群,该基因群内近年分离出的中国4个不同大地区(西北、华东、东北、西南)的RHDV毒株与NJ85株遗传距离很近,很可能都来自同一毒株NJ85.同时,对4个不同大地区的近年的4个代表性分离株的二级结构、抗原性进行了预测分析,结果显示二级结构有一定差异,但抗原性相同,这与RHDV只有一个血清型的看法相一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭蔼光	西北农林科技大学生命科学学院	110	1264	19.0	27.0
2	杨增岐	西北农林科技大学动物科技学院	113	812	16.0	23.0
3	张守涛	郑州大学生命科学学院	18	65	5.0	7.0
4	李传山	西北农林科技大学生命科学学院	4	37	4.0	4.0
5	杨颖	西北农林科技大学生命科学学院	3	45	3.0	3.0