BLASTALIGN在同源基因片段检索中的应用

• 作者: 乔慧杰 史卫峰 周宏宇 张彦周 朱朝东 罗阿蓉
• 来源期刊: 动物分类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: BlastAlign GenBank 小蜂总科 28S rDNA D2区.
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 页码范围: 861-864
• 页数: 4页
• 分类号: Q961
• 字数: 4771字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0739.2007.04.020

摘要

多序列比对程序的开发在生物信息学中是一个很活跃的研究领域.作为一种新诞生的多序列比对程序,BlastAlign利用blastn算法进行序列比对,并且采用空位替代比对结果中的高变区.目前,该程序主要用于多条基因序列的比对研究.本文则以获取膜翅目小蜂总科28S rDNA D2区基因片段为例,通过应用BlastAlign的序列比对过程,提供一种较为简便和有效的方法,实现从GenBank数据库中检索并筛选特定的同源基因序列,从而克服目前利用关键词或检索式进行检索所存在的局限性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	史卫峰		19	70	6.0	7.0
2	张彦周	中国科学院动物研究所	39	235	7.0	14.0
3	朱朝东	中国科学院动物研究所	55	375	11.0	18.0
4	罗阿蓉	中国科学院动物研究所	4	9	2.0	3.0
8	乔慧杰	中国科学院动物研究所	1	2	1.0	1.0