家蚕滞育生物钟蛋白质EA4基因的cDNA克隆和序列分析

• 作者: 丛海峰 刘莹 司马杨虎 吴阳春 徐世清 柳学广 王玉军
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕 滞育 时间间隔测定酶 酯酶A4基因 cDNA序列
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 36-42
• 页数: 7页
• 分类号: S881.2|Q78|Q965
• 字数: 4893字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2007.01.007

摘要

家蚕滞育生物钟是依赖卵内酯酶A4(EA4)的倒计时型生物钟.EA4是具时间间隔测定酶(time interval measuring enzyme,TIME)功能的蛋白质.根据家蚕EA4测定的氨基酸序列,以第3天龄雌蛹脂肪体和卵巢总RNA为模板,利用简并引物RT-PCR方法,得到308 bp的部分ea4序列,其1-144 nt和145-308 nt分别与家蚕全基因组鸟枪序列(whole genome shotgun sequence,WGS) AADK01019126.1的5 595-5 738 nt及WGS AADK01014467.1的8 636-8 473 nt有95%和98%的一致性.根据获得的ea4基因片段序列,利用生物信息学方法和家蚕基因组数据预测了ea4基因的完整cDNA序列,设计特异引物,以雌蛹脂肪体和卵巢RNA为模板,进行RT-PCR得到完整的cDNA.ea4基因的cDNA全长519 bp,其中1-48 bp为信号肽序列,49-519 bp编码的氨基酸与蛋白质纯化后测序EA4部分的一致性为98%,C末端存在3个氨基酸的差异,其中第156位为新确定氨基酸.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	司马杨虎	苏州大学生命科学学院	90	737	16.0	23.0
2	徐世清	苏州大学生命科学学院	115	923	18.0	25.0
3	王玉军	苏州大学生命科学学院	5	61	4.0	5.0
4	柳学广	苏州大学生命科学学院	6	96	4.0	6.0
5	丛海峰	苏州大学生命科学学院	2	40	2.0	2.0
6	刘莹	苏州大学生命科学学院	4	40	2.0	4.0
7	吴阳春	苏州大学生命科学学院	4	35	3.0	4.0