金鱼Vsx1基因结构及其内含子多态性分析

• 作者: 刘正华 李冰霞 童英 罗琛 郑康 陈金辉
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 金鱼 Vsx1 基因结构 内含子 多态性
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 418-423
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S965.8
• 字数: 3996字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2007.04.007

摘要

Vsx1是第一个在金鱼中发现的编码含有同源异型框(homeodomain)和CVC结构域蛋白的基因.该基因在胚胎发育的不同阶段在胚胎的不同区域和不同组织中表达,并已经证明它在视网膜视锥双极细胞的分化和正常功能的维持中具有重要作用.为了进一步研究该基因在不同发育阶段组织特异性表达的调节机制,实验用PCR方法分析了金鱼Vsx1的基因组结构和内含子多态性.结果表明:金鱼Vsx1基因由5个外显子和4个内含子组成,与斑马鱼、人、小鼠的Vsx1基因结构相同.4个内含子中,第一内含子有两种序列差异明显的类型,但第二、三、四内含子无明显差异.第一内含子的一种类型比另外一种类型多39个碱基,这39个碱基中包括了真核生物增强子的核心序列.这一观测结果提示金鱼Vsx1第一内含子可能与该基因的发育阶段特异性和组织特异性表达调节有关.同时,第一内含子序列的明显差异也为分析Vsx1不同等位基因或基因拷贝的表达活性,以及组织特异性表达调节方式提供了合适的探针序列.